Ajaran makrifat Jawa berasal dari para wali legendaris yang sudah tidak asing lagi namanya di tanah Jawa ini, tak terkecuali juga peran penting Syekh Siti Jenar. Selanjutnya, ilmu tersebut dilestarikan oleh generasi berikutnya termasuk puncaknya oleh petinggi Kerajaan Mataram, Sultan Agung. Agar tidak punah, ajaran makrifat ini terus saja dijaga, dikembangkan, dan diamalkan, baik oleh pihak keraton, pihak ulama, maupun masyarakat umum di Jawa yang meminatinya. Hingga akhirnya ajaran ini juga sangat akrab dengan kaum Kejawen dan menjadi pelajaran pokok yang penting untuk dipelajari.